Fabio Martignon è attualmente Professore Ordinario, da giugno 2017, presso l'Università degli Studi di Bergamo, nel Dipartimento di Ingegneria Gestionale, dell'Informazione e della Produzione.
Ha conseguito la Laurea in Ingegneria delle Telecomunicazioni nel 2001 e il Dottorato Europeo in Ingegneria Informatica nel 2005, entrambi con lode, presso il Politecnico di Milano, ottenendo il premio Chorafas per la migliore tesi di dottorato. Nel 2010 ha ricevuto l'Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) dall'Université Pierre et Marie Curie (Paris 6).
Da settembre 2011 a maggio 2017 è stato professore ordinario ("Professeur des Universités") presso l'Université Paris-Sud, lavorando presso il Laboratoire de Recherche en Informatique (l'Université Paris-Saclay è attualmente al 15° posto nel mondo secondo il ranking accademico di Shanghai). Nell'aprile 2011 si è inoltre classificato 1° su 82 partecipanti al concorso francese per ricercatori senior "CR1", sezione Informatica.
È stato Junior Member (ottobre 2013-maggio 2017) dell'Institut Universitaire de France (solo il 2% dei professori universitari francesi sono stati attualmente distinti dall'IUF), e membro del comitato di selezione dell'IUF nel 2016, 2017 e 2018.
I suoi lavori appaiono sulle principali riviste di networking (come IEEE Transactions on Mobile Computing, IEEE TCC, IEEE TMC, IEEE TPDS, IEEE TVT, IEEE TWC, IEEE TNSM, Elsevier Computer Networks, COmputer Communications and Ad Hoc Networks, Wireless Communications and Mobile Computing) e nelle più prestigiose conferenze di networking. Le sue attività di ricerca si sono svolte nell'ambito di progetti finanziati dall'Unione Europea, dal Ministero della Ricerca Italiano (progetti PRIN) e da diverse aziende (Alcatel, Siemens e Espia/VoiSmart).
È membro senior dell'IEEE.